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谷子组蛋白H3基因家族的鉴定与分析

Identification and Analysis of Histone H3 Gene Family in Foxtail Millet

摘要组蛋白(Histone)是构成染色质的基本结构蛋白,其中组蛋白H3的氨基酸序列十分保守,并且其在维持染色质结构稳定性、调控植物生长发育以及应对环境变化方面具有重要作用.为探究谷子组蛋白H3基因家族成员的结构和功能,为谷子组蛋白H3的生物学功能研究奠定理论基础,研究从xiaomi和豫谷1号(YG1)基因组中分别鉴定出15个组蛋白H3基因,并依次命名为SiH3.1~SiH3.15;进而利用生物信息学技术比较并分析SiH3在染色体上的分布情况、系统进化关系、基因结构、保守基序、保守结构域、启动子顺式作用元件、亚细胞定位及组织表达情况.结果表明,除xiaomi中的SiH3.2和SiH3.13、YG1中的SiH3.10.1和SiH3.11.1外,其他基因在染色体的位置均一一对应.进化关系结果显示,SiH3分属4类,其中,xiaomi的4个类别中依次有6、1、6、2个基因,YG1依次有4、2、7、2个基因;2个品种亚组内基因间结构、保守基序、结构域相似,亚细胞定位均在细胞核;启动子顺式作用元件主要与植物生长发育调控、逆境响应相关.表达模式结果显示,同属于H3.3亚组的SiH3.7和SiH3.15在不同组织中呈现组成型高表达,且在穗中表达量显著高于其他组织,说明二者在谷子全生育期,特别是生殖生长阶段起到了重要作用,暗示其在谷子生产实践中具有重大的应用潜力.

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分类号 S515
DOI 10.3969/j.issn.1002-2481.2023.10.05
发布时间 2023-10-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
山西省基础研究计划项目(20210302123383)
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