基于转录组测序及韦恩分析探寻补气中药制剂发挥补气作用的靶基因及其生物学功能
Target genes and biological functions related to tonifying Qi of Chinese medicine preparation based on transcriptome RNA sequencing and Venn analysis
摘要目的:探寻益气复脉/参芪扶正注射液发挥补气作用的潜在靶基因及其生物学功能.方法:利用高通量转录组测序技术,考察气虚患者经益气复脉/参芪扶正注射液治疗后,其外周血单核细胞的差异表达基因、GO(Gene Ontotology)分析及KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)分析,并进一步进行韦恩分析,明确2个制剂治疗后共同的差异基因及生物学功能,最后利用一组临床队列样本,通过实时定量PCR,验证并明确与补气密切相关的基因.结果:两组共有的GO条目,包括生物过程的有32条,细胞组分的有2条,分子功能的有6条,生物通路有10条.共表达差异基因有6个,包括DUSP1、DUSP2、FKBP5、F8A2、C9orf129 EGR1.临床队列样本显示,FK-BP5的下调有统计学差异(P=0.001).结论:MAPK信号通路是益气复脉和参芪扶正发挥补气作用的核心通路,FKBP5基因水平下调是它们发挥补气作用的分子标志.
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