换一批溃疡性结肠炎及其恶性并发症的生物信息学分析和潜在治疗药物筛选
Bioinformatics analysis of ulcerative colitis and its malignant complications and screening of potential therapeutic drugs
摘要目的 ·利用生物信息学分析探究溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)及其恶性并发症的致病相关基因及潜在的药物治疗靶点.方法 ·从GEO (Gene Expression Omnibus)数据库下载4个基因表达数据集(GSE13367、GSE9452和GSE36807为UC组,GSE37283为UCN组),采用联合分析筛选差异基因.结合后续的免疫分析及基因相关性分析得到与UC及其恶性并发症相关的关键基因,并利用LINCS L1000数据库筛选若干具有潜在治疗效果的小分子药物.结果 ·通过对UC组及UCN组数据集的2次差异基因分析分别筛选出86个和253个显著差异表达基因.针对UC组差异基因的蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络进行的评分分析显示网络的核心基因为CXCL8 (C-X-C motif chemokine ligand 8).KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析表明CXCL8主要参与了IL-17信号通路中对中性粒细胞的招募作用.基于LINCS L1000数据库的筛选结果共发现3种针对CXCL8的小分子药物——紫铆因、左旋西替利嗪、伪麻黄素.结论 ·分析得到的核心差异表达基因CXCL8可能会成为治疗UC及其恶性并发症的新药物靶点.筛选出的3种小分子药物可能对UC及其恶性并发症具有潜在的治疗效果.
更多相关知识
医学主题词
基因(Genes)结肠炎, 溃疡性(Colitis, Ulcerative)计算生物学(Computational Biology)药物评价, 临床前(Drug Evaluation, Preclinical)语言(Language)
分类号
R574.1（消化系及腹部疾病）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1674-8115.2020.03.007
发布时间
2020-05-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
- 浏览0
- 被引8
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
