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长非编码RNA LINC00467在肺腺癌中的表达及其影响肺腺癌进展的机制研究

Expression of long noncoding RNA LINC00467 and its mechanism in affecting lung adenocarcinoma progression

摘要目的·探究长非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)LINC00467在肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)中的表达情况及其对患者不良预后的影响,并揭示其调控LUAD发生发展的作用及潜在分子机制.方法·首先,利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中的肿瘤样本数据,分析LINC00467在LUAD组织中的表达水平及其与患者生存期的相关性.其次,构建LINC00467稳定敲低LUAD细胞系,通过细胞表型实验(即活细胞成像检测细胞增殖实验、平板克隆形成实验、细胞划痕实验)及裸鼠皮下成瘤实验,评估LINC00467对LUAD细胞增殖、克隆形成、迁移及成瘤能力的影响.进一步,通过转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术、差异表达基因(differentially expressed gene,DEG)分析和hallmark gene sets富集分析,探究LINC00467调控肿瘤细胞的相关信号通路,并利用蛋白质印迹法(Western blotting)验证其对肿瘤细胞通路的影响.最后,通过RNA pull-down联合蛋白质谱以及免疫共沉淀(co-immunoprecipitation,co-IP)实验,筛选并验证LINC00467的相互作用蛋白.结果·TCGA数据库的肿瘤样本数据的分析结果表明LINC00467在LUAD中异常高表达,且其表达水平与LUAD患者的生存期呈负相关(P=0.004).细胞表型实验及裸鼠皮下成瘤实验的结果均显示,敲低LINC00467可显著抑制LUAD细胞的增殖、克隆形成、迁移和体内成瘤的能力(均P<0.05).RNA-seq、DEG分析、hallmark gene sets富集分析及蛋白质印迹的结果均表明,敲低LINC00467可抑制核因子κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)信号通路的激活.RNA pull-down联合蛋白质谱和co-IP的结果表明LINC00467与酪蛋白激酶2α2(casein kinase 2 alpha 2,CSNK2A2)存在相互作用,并促进NF-κB p65的磷酸化.结论·LINC00467在LUAD组织中的高表达与患者预后呈负相关;LINC00467可以与CSNK2A2相互作用,促进NF-κB p65的磷酸化,激活NF-κB通路,促进LUAD增殖、克隆形成、迁移和体内成瘤.

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