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不同代次的猪细小病毒(PPV S-1株)NS1基因的克隆与序列分析

Cloning and sequence analysis of the NS1 gene of porcine parvovirus S-1 isolate from different passages

摘要根据GenBank中猪细小病毒PPV NADL-2株NS1基因序列设计了一对引物,以PPV S-1分离株不同传代代次的DNA为模板,进行PCR扩增,将扩增产物分别克隆到pGEM-T载体中进行测序.结果表明:扩增片段长约2.2 kb,包含完整的MS1基因,共编码662个氨基酸.应用DNAStar软件进行序列分析,结果显示:所有代次的NS1核苷酸同源性在99.4%以上,氨基酸同源性在98.5%以上;PPV S-1分离株在传代致弱的过程中,NS1基因出现了一些变异,有4处较为一致的突变,即1 052位C→T、1 636位G→A、1 717位A→G、1 732位T→G,对应的氨基酸变化分别为Thr~(351)→Met~(351)、Val~(546)→Met~(546)、Asn~(573)→Asp~(573)、Ser~(578)→Ala~(578),这可能是PPV S-1在ST细胞上传代致弱的分子基础之一.

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