目标序列捕获二代测序技术在苯丙酮尿症基因诊断中的应用

Application of captured high throughput sequencing in the genetic diagnosis of phenylketonuria

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摘要目的评估目标序列捕获二代测序技术在苯丙酮尿症(phenylketonuria,PKU)基因诊断中的应用价值.方法采用目标区序列捕获及第二代测序技术对9例经典型PKU患者的苯丙氨酸羟化酶(phenylalanine hydroxylase,PAH)基因进行检测;采用Sanger测序技术对患者及其父母基因突变型进行验证.结果 9例患者检测到PAH基因的12种致病性突变,包括7种错义突变(p.I65T、p.F161S、p.Q204C、p.R241C、p.L242F、p.R243Q和p.Q375E),2种无义突变(p.R111X和p.Y356X),3种剪接突变[c.442-1G＞ A(IVS4-1G＞ A)、c.1315+ 6T＞A(IVS12+ 6T＞ A)和c.1316-2A＞C(IVS12-2A＞ C)],以及3种非致病性的变异(p.Q232Q、p.V245V和p.L385L),致病性突变均来自患者父母.其中,2个致病性突变未见报道,分别为c.1316-2A＞C和p.Q375E(CAA-＞GAA).结论目标序列捕获二代测序可以准确检测出PAH基因突变,对遗传病因明确的疾病具有一定的临床应用价值.

作者陈瑛 ^[1] 魏晓明 ^[2] 王本敬 ^[3] 易鑫 ^[2] 毛君 ^[4] 学术成果认领

作者单位 南京医科大学附属苏州医院新生儿科-中心实验室苏州215002 ^[1] 深圳华大基因研究院深圳518083 ^[2] 南京医科大学附属苏州医院妇科苏州215002 ^[3] 南京医科大学附属苏州医院产科苏州215002 ^[4]

关键词苯丙酮尿症苯丙氨酸羟化酶序列捕获第二代测序技术 phenylketonuria phenylalanine hydroxylase target sequence capture sequencing next-generation sequencing

主题词苯丙酮尿症(Phenylketonurias)基因(Genes)苯丙氨酸羟化酶(Phenylalanine Hydroxylase)突变(Mutation)诊断(Diagnosis)

分类号 R596.2 R394

栏目名称 方法技术

DOI 10.3969/j.issn.1672-8467.2015.03.021

发布时间 2015-07-20

基金项目

江苏省“十二五”科教兴卫工程医学重点人才资助项目 苏州市生殖与遗传转化医学重点实验室建设项目(SZS201206) This work was supported by the "Twelfth Five-Year Plan" Key Medical Talents Project in Science and Education of Jiangsu Province Suzhou Key Lab of Translational Medicine Project