换一批非小细胞肺癌中PTCH1-3’-UTR调控的lncRNAs的ceRNA网络
Identification of PTCH1-3'-UTR regulated lncRNAs associated with competing endogenous RNA networks in non-small cell lung cancer cell line
摘要目的 研究PTCH1-3'-UTR对lncRNAs表达水平的影响,通过调控网络的分析,提示PTCH1-3’-UTR的功能.方法 通过芯片筛选非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中调控PTCH1-3'-UTR的lncRNAs,并对部分结果进行荧光定量PCR验证.通过GO和KEGG通路分析调控PTCH1-3'-UTR的lneRNAs可能的生物学功能.通过TCGA数据分析调控PTCH1-3'-UTR的lncRNAs与NSCLC患者生存率的直接关系.结果 荧光定量PCR验证了PTCH1-3'-UTR上调表达的lncRNAs(LOC100507547,FAM41C,DOCK4-AS1,AC009305.1,KLF7-IT1,RP11-749H20.1,LINC01511).GO和KEGG通路分析结果显示,调控PTCH1-3,-UTR的lncRNAs与一系列的生物过程,包括基因转录、信号转导、蛋白质转运、翻译延伸以及钙信号通路、Jak STAT信号通路、p53信号通路、胰岛素信号通路有关.TCGA数据分析的结果表明,调控PTCH1-3,-UTR的lncRNAs中,NSCLC患者中高表达lncRNA-CDKN2BAS或FAM66D者预后较差,而高表达lncRNA-LINC00240、LOC400027、ABCC6P2或FLJ 10038者可能预示高存活率.结论 本研究结果提示了PTCH1-3'-UTR的功能,调控PTCH1-3'-UTR的lncRNA可作为NSCLC预后标志物.
更多相关知识
关键词
长链非编码RNAPTCH1-3'-UTR内源竞争性RNA网络表达谱非小细胞肺癌long non-coding RNAPTCH1-3'-UTRcompeting endogenons RNA networkexpression profilingnon-small cell lung cancer
分类号
R73（肿瘤学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1672-8467.2018.03.004
发布时间
2018-07-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
Shanghai Municipal Natural Science Foundation（(14ZR1403700)）
the General Program of National Natural Science Foundation of China （(81773024)）
上海市自然科学基金（(14ZR1403700)）
国家自然科学基金面上项目（(81773024)）
- 浏览150
- 被引1
- 下载34
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
