感音神经性耳聋的潜在药物靶点:一项跨组织转录组关联研究
Potential drug targets for sensorineural hearing loss:a cross-tissue transcriptome-wide association study
摘要目的 基于跨组织转录组关联研究(transcriptome-wide association study,TWAS)识别感音神经性耳聋(sensorineural hearing loss,SNHL)的易感基因及潜在药物靶点.方法 采用跨组织TWAS鉴定SNHL的候选基因.其次,采用基于功能摘要的融合插补法(functional summary-based imputation,FUSION)来验证候选基因在单个组织中的结果,并基于基因组注释多标记分析法(multimarker analysis of genomic annotation,MAGMA)进一步筛选候选基因.采用基于汇总数据的孟德尔随机化(summary data-based Mendelian randomization,SMR)和共定位分析进一步推测候选基因与SNHL的因果关系.通过基因功能富集分析探索候选基因及其功能意义,并对已鉴定基因的成药性进行评估,以期发现潜在候选药物.结果 通过跨组织TWAS共鉴定出22个候选基因.由FUSION和 MAGMA 证实,8 个候选基因(SPTBN1、EML6、SLC16A8、ARHGAP28、ASCC2、C2orf73、MICALL1和GCAT)与SNHL具有显著相关性.SMR和共定位分析进一步验证了以上候选基因与SNHL具有因果关系.基于数据库挖掘和分子对接预测,提示磷酸吡哆醛为SNHL的潜在候选药物.结论 共确定8个与SNHL风险相关的易感基因及潜在药物靶点,其中GCAT与已上市化合物磷酸吡哆醛关联,为SNHL的"老药新用"策略提供了遗传学依据.
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