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厦门地区A组轮状病毒VP4基因序列特征

Sequence characteristics of VP4 gene of group A rotavirus in Xiamen

摘要目的 了解厦门地区P型A组轮状病毒VP4基因序列和遗传变异特征,及其与国内外VP4基因的差异.方法 收集2021年1-12月厦门市儿童医院100例<10岁腹泻患儿轮状病毒检测阳性的粪便样本.采用巢式聚合酶链反应(PCR)进行A组轮状病毒G基因型和P基因型分型.用一代测序技术进行A组轮状病毒VP4基因全长序列测序,用DNA Star、MEGA 等生物学软件对测序后获得的基因序列进行系统进化分析和氨基酸序列比对.结果 100例腹泻患儿粪便样本G基因型主要流行株为G9型(88株),P基因型主要流行株为P[8]型(87株),G/P组合基因型主要流行株是G9P[8]型(80株).进化树分析结果显示,厦门地方株(Amoy)与国内外其他地方株在进化树内的关联性存在不同程度的差异.氨基酸比对分析结果显示,厦门地方株(Amoy)与国内外不同地方株的氨基酸一级结构存在不同程度的变异.结论 A组轮状病毒VP4基因全长可显示毒株在中国具有快速适应和变异的能力.建议对轮状病毒的遗传变异进行持续监测.

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2025年40卷12期

1209-1215页

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