N6-甲基腺苷相关长非编码RNA作为胃癌患者预后预测的潜在生物标志物
N6-methyladenosine related long noncoding RNAs as a potential biomarker for predicting the prognosis of gastric cancer patients
摘要RNA甲基化占整个RNA修饰的 60%以上,而N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修饰是人类最常见的一种RNA修饰.m6A修饰对基因表达的调节至关重要,其失调与多种疾病如肿瘤相关.我们以癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)胃癌数据集中的 375 例患者为对象,研究了m6A相关长非编码RNA(long noncoding RNAs,lncRNAs)的预后意义:先进行Pearson相关性分析,以筛选m6A相关lncRNAs,然后再进行单变量Cox回归分析,确定胃癌患者的预后.确定 23 种m6A相关lncRNAs为预后lncRNAs后,运用LASSO-Cox回归方法,在TCGA胃癌数据集中构建m6A相关lncRNAs(包括 9 种m6A相关预后lncRNAs)预后模型.通过计算相关风险评分,并根据风险评分的中位值将胃癌患者分为低、高风险亚组.生存分析曲线和受试者操作特征曲线显示,此预后模型能对胃癌患者的预后进行可靠的预测.本研究揭示了m6A RNA甲基化调节剂在胃癌发生发展中的重要性,并建立了一种m6A基因表达分类模型,该模型可以令人满意地预测胃癌的预后.
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