换一批
换一批新疆加工番茄上一种类似南方番茄病毒的分子检测
Molecular Detection of a Virus Similar to Southern Tomato Virus (STV) of Processing Tomato in Xinjiang
摘要在对加工番茄里格87-5进行RNA测序时,我们发现存在南方番茄病毒的基因组序列,序列包含STV除5’末端12 bp和3’末端35 bp的其它全部3390 bp的RNA序列,其中只有5个碱基存在差异(与EF442780相比),说明里格87-5感染了STV.为了快速检测加工番茄品种的病毒感染情况,我们设计了STV特异性的PCR引物STV168F/STV745R,用一步法RT-PCR方法,从里格87-5的总RNA中扩增得到了预期的577 bp的扩增产物,回收、克隆到pGEM-T上,提取质粒经EcoRI酶切鉴定后进行序列测定,与已报道的STV的序列同源性为99％～100％,表明该片段是STV特异性的.运用这项技术调查了20份加工番茄材料,结果显示,有3份材料的全部植株均带毒,13份材料均不带毒,另外4份材料部分带毒.同时,在新疆石河子蔬菜花卉研究所随机采集了加工番茄叶片样品,统计大田检出率约为28％.
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关键词
新疆加工番茄南方番茄病毒一步法RT-PCR检测Xinjiangprocessing tomatosouthern tomato virus(STV)one-step RT-PCRdetection
栏目名称
农学·植物保护
DOI
10.3969/j.issn.1007-7383.2013.03.002
发布时间
2013-08-19
基金项目
国家自然科学基金项目
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