摘要目的 本研究旨在研究 1 株牛源溶酪巨型球菌(Macrococcus caseolyticus,M.caseolyticus)的致病性和全基因组特征,挖掘该菌株的毒力和耐药相关基因.方法 在新疆石河子市某牛场中采集 1 例病死牛肺脏,从牛肺脏灌洗液中分离鉴定了 1 株牛源溶酪巨型球菌,在此基础上进行了药敏试验、动物感染试验;并通过 Illumina 的二代测序技术对该菌株进行全基因组框架图构建,构建多个管家基因同源进化树,对编码基因、重复序列、非编码 RNA 等进行预测,并在GO、KEGG、COG、NR和CAZy数据库对基因组的基本功能特征进行注释,结合NR数据库的注释和PHI、CARD 数据库注释,明确其基因组中毒力因子、耐药性等相关基因.结果 从牛肺中成功分离到一株M.caseolyticus,通过感染兔子试验证实该菌株具有较强的致病性,病理切片结果显示兔子肺泡数量减少,大量炎性细胞渗出,肺泡囊增大,肺泡囊中充满渗出物,红细胞渗出,细支气管管壁塌陷.该菌经平均核苷酸相似度分类和系统发育树确定为溶酪巨型球菌,全基因组大小为 2 209 314 bp,CG％含量为 37.22％,平均长度为 855 bp,编码 2 304 个基因;其中tRNA有 58 个、rRNA有 8 个、sRNA有 1 个;含有 3 条 CRISPRs序列.在 GO数据库中有 1 028 个基因得到注释,分别注释到分子功能、细胞组分和生物过程 3 大类;在 KEGG数据库中共有 1 420 个编码基因得到注释;在 COG 数据库中,共注释有 23 种功能的 1 961 个基因;同时,在全基因组测序结果中发现 51 个毒力因子和对氨基糖苷类、β-内酰胺类和多肽类等抗生素的多种耐药基因,药物敏感性试验中菌株对测试的 12 类抗生素仅对磺胺类(复方新诺明)、林可霉素类(林可霉素)、青霉素类(氨苄西林)耐药.结论 本研究从病死牛肺脏中分离得到 1 株牛源溶酪巨型球菌并命名为 SHZXbov7,该菌具有较强的致病性,含有多种毒力因子和耐药基因,菌株 SHZXbov7 的基因组测序和注释将丰富溶酪巨型球菌的基因数据库,为溶酪巨型球菌相关疾病的防控提供参考.