换一批基于DAP-seq方法探索SmWRKY69的靶基因及其调控网络(英文)
Based on DAP-seq method:exploring target genes and regulatory network of SmWRKY69
摘要目的:中药丹参是临床常用的活血化瘀药,主要用于心脑血管疾病的治疗,其关键活性成分丹参酮是决定丹参药材发挥临床疗效的重要活性成分.阐明其生物合成转录调控机制对于提升丹参品质具有重要理论意义,对天然药物资源的保护和可持续利用至关重要.方法:通过转录组测序分析,发现转录因子SmWRKY69 在丹参根系周皮组织中特异表达.利用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术,识别了其潜在的靶基因,通过顺式作用元件分析预测SmCPS1 和SmKSL1 启动子中存在W-box元件.随后,采用酵母单杂交(Y1H)实验验证SmWRKY69 与候选基因启动子的调控关系.结果:研究发现,SmWRKY69 能够通过W-box元件直接与丹参酮生物合成途径中的关键基因SmCPS1 和SmKSL1 的启动子区域相结合,表明其在转录调控中发挥了重要作用.结论:转录因子SmWRKY69 通过直接调控SmCPS1 和SmKSL1 的表达,参与丹参酮的生物合成,从而为提升丹参的药用品质提供了重要的代谢工程靶点.
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关键词
丹参酮转录调控WRKY转录因子DNA亲和纯化测序tanshinonetranscriptional regulationWRKY transcription factorsDNA affinity purification sequencing
栏目名称
DOI
10.16306/j.1008-861x.2025.04.004
发布时间
2025-08-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（82374159）
国家自然科学基金（82304662）
中央本级重大增减支项目（2060302）
上海市晨光计划资助项目（23CGA52）
上海中医药大学科技发展项目（23KFL051）
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