换一批基于丹参单细胞转录组数据和DAP-seq方法探索SmMYB26的靶基因及其调控网络
Exploration on target gene and regulatory network of SmMYB26 based on single cell transcriptome data of Radix Salvia miltiorrhizae and DAP-seq
摘要目的:揭示丹参根系周皮细胞特异性调控机制,发掘细胞异质性的核心调控基因.方法:基于单细胞转录组测序(scRNA-seq)分析,鉴定到转录因子SmMYB26 在根系周皮细胞类群中具有特异性表达.采用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)获得其基因组结合图谱,并对SmKSL1 启动子顺式元件进行分析,筛选潜在结合序列.通过酵母单杂交(Y1H)实验验证SmMYB26 与SmKSL1 启动子的结合关系.结果:DAP-seq结果显示,SmMYB26 可能对丹参酮合成途径关键酶基因 SmKSL1 具有调控作用,且其主要结合位点为 CCTG-box.Y1H 实验进一步证明了SmMYB26 能够结合SmKSL1 启动子,提示其在SmKSL1 的转录调控中发挥作用.结论:本研究揭示了转录因子SmMYB26 通过结合CCTG-box位点调控SmKSL1 表达的分子机制,为阐明丹参酮生物合成的转录调控网络提供了新的视角和理论依据.
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关键词
丹参丹参酮合成途径MYB转录因子单细胞转录组测序DNA亲和纯化测序Radix Salvia miltiorrhizaetanshinone biosynthesis pathwayMYB transcription factorscRNA-seqDAP-seq
栏目名称
DOI
10.16306/j.1008-861x.2025.06.006
发布时间
2026-01-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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