换一批不平衡数据处理方法对中药不良反应预测的应用研究
Application Research of Imbalanced Data Processing Methods on Prediction of Adverse Reactions of Traditional Chinese Medicine
摘要目的:针对中药不良反应数据的不平衡性,探索并应用不平衡数据的处理方法,对中药的不良反应进行预测.本文以使用丹红注射液的患者为研究对象,对来自37家医院集中监测数据进行深度挖掘,在使用了丹红注射液的患者中预测是否发生不良反应.方法:从数据层面采用四种方法:不处理、随机欠采样、随机过采样、SMOTE采样;从算法层面采用四种模型或算法:决策树、随机森林、AdaBoost算法、Gradient Boosting算法,对数据的不平衡性进行处理.两个层面的方法两两结合,对16种方法与模型或算法组合的预测效果进行比较.结果:随机欠采样和AdaBoost算法相结合、随机欠采样和Gradient Boosting算法相结合的预测效果较为理想,recall和G-mean都达到80％以上,AUC指标也高达0.86.结论:初步探索中药不良反应可能适用的不平衡数据处理方法,预测结果结合实际经验,能较准确地预测使用了丹红注射液的患者是否发生不良反应,在临床实际应用中能起到一定的警示作用.同时,根据输出的变量重要性排名,能最大程度地避免用药后的不良反应的发生,为丹红注射液的安全性再评价提供一些科学参考依据.
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关键词
不平衡数据不良反应集中监测数据采样boostingImbalanced dataadverse reactioncentralized monitoring datasamplingboosting
分类号
R33（人体生理学）
栏目名称
DOI
10.11842/wst.2017.09.008
发布时间
2018-06-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（81502898）
重大新药创制"科技重大专项（2015ZX09501004-001-007）
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