换一批
换一批党参蛋白激酶SnRK2家族鉴定及其与转录因子的相关性研究
Identification of Protein Kinases SnRK2 Family in Codonopsis pilosula and its Correlation with Transcription Factors
摘要目的 通过对党参蛋白激酶SnRK2家族鉴定,以及对其与转录因子的相关性进行初步解析,为党参抗根腐病机制的解析及高抗性优质党参新品种培育提供数据支撑.方法 基于党参转录组,采用生物信息学手段对CpSnRK2基因家族进行系统性研究.结果 在党参中鉴定到6个CpSnRK2基因家族成员(CpSnRK2.1-CpSnRK2.6),属于3个亚家族,同一亚族成员之间的蛋白基序分布相似.表达模式分析表明CpSnRK2 以及转录因子(WRKY、MYB、ERF、bHLH)在尖孢镰刀菌侵染下存在着时间差异性.同时,CpSnRK2基因和转录因子WRKY、MYB、ERF及bHLH之间存在着显著相关性.结论 本研究揭示了CpSnRK2(CpSnRK2.4和CpSnRK2.6)与转录因子WRKY、MYB、ERF以及bHLH共同调控党参对尖孢镰刀菌的响应,为进一步研究CpSnRK2基因对党参根腐病的响应提供了重要线索.
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关键词
党参根腐病SnRK2转录组表达模式转录因子C.pilosulaRoot rotSnRK2TranscriptomeExpression analysisTranscription factors
分类号
R282.71
栏目名称
中药学研究
DOI
10.11842/wst.20230219003
发布时间
2024-05-17
基金项目
国家重点研发计划
国家重点研发计划
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