换一批
换一批基于SCAR标记和DNA条形码技术的苍术基原鉴别研究
Identification of Atractylodes chinensis and A.japonica Based on SCAR Molecular Markers and DNA Barcoding Technology
摘要目的 开发出能同时鉴别北苍术和关苍术的分子标记方法,并探究不同种质资源苍术的遗传进化关系.方法 对不同地区北苍术Atractylodes chinensis(Bunge)Koidz及关苍术A.japonica Koidz.ex Kitam基因组DNA的差异片段进行测序,结合SRAP、ISSR、DAMD分子标记方法,优化PCR反应体系,筛选并转换成特异性标记,同时,采用条形码方法分析种间序列差异.结果 通过SRAP、ISSR、DAMD三种分子标记方法的PCR扩增,共筛选出198对能稳定扩增且重现性好的引物,转换出7对能稳定、快速鉴别北苍术和关苍术的SCAR引物.条形码方法检测出北苍术ITS2序列长度为454 bp,关苍术ITS2序列长度为453 bp,与其他苍术属植物之间遗传距离较远.NJ树结果显示,北苍术、关苍术及其他苍术属植物均各自聚为一支,表现出良好的单系性.依据ITS2二级结构,4种苍术属植物在螺旋区的茎环数目、大小、位置均有明显差异,可以直观地进行区分.结论 所开发的特异性SCAR标记为苍术属植物优良品种的筛选提供了新方法,DNA条形码能稳定、准确鉴别北苍术.
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关键词
北苍术关苍术Internal transcribed spacer 2(ITS2)Sequence-related amplified polymorphism(SRAP)Inter-simple sequence repeat(ISSR)Atractylodes chinensis(Bunge)KoidzAtractylodes japonica Koidz.ex KitamInternal transcribed spacer 2(ITS2)Sequence-related amplified polymorphism(SRAP)Inter-simple sequence repeat(ISSR)Direct amplification of minisatellite region DNA(DAMD)Sequen
分类号
R-058
栏目名称
DOI
10.11842/wst.20230204001
发布时间
2024-05-17
基金项目
吉林省教育厅科学技术研究项目（JJKH20220874KJ）；
吉林省科技发展计划项目（20200708041YY）
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