基于网络药理学-分子对接技术和斑马鱼模型探究莪术-三棱药对调控血管生成抗肺癌作用机制
Study on the Mechanism of Angiogenesis-Regulating Anti-Lung Cancer Action of Herbal Couple Curcumae Rhizoma-Sparganii Rhizoma Based on Network Pharmacology-Molecular Docking and Zebrafish Model
摘要目的 采用网络药理学和分子对接技术预测莪术-三棱(Curcumae Rhizoma-Sparganii Rhizoma,CR-SR)药对调控血管生成抗肺癌作用机制,并通过斑马鱼模型进行初步验证.方法 采用网络药理学方法筛选CR和SR的活性成分及其靶点,分别与从OMIM database和GeneCards数据库筛选得到的肺癌和抗血管生成靶点取交集,取交集靶点构建药对-肺癌和药对-抗血管生成的蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-protein interaction,PPI)网络,筛选药对-肺癌和药对-抗血管生成的共有靶点和核心靶点.通过Metascape数据库对药对-肺癌和药对-抗血管生成的核心靶点进行基因本体(Gene ontology,GO)功能、京都基因与基因组的百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析.采用分子对接技术评价核心靶点与活性成分的结合能力,分析结合作用力及参与的氨基酸残基.体外采用CCK-8法探讨CR-SR药对、CR和SR对人脐静脉内皮(HUVECs)细胞活力的影响.将斑马鱼胚胎随机分为空白对照组、不同浓度药对及单味药组、阳性药对照组,72 h后统计各组斑马鱼节间血管数,采用qRT-PCR技术检测血管生成相关基因VEGFA、VEGFR2、VEGFR3、EGFR等mRNA表达水平.结果 网络药理学分析筛选获得药对-肺癌共同靶点106个,药对-抗血管生成共同靶点130个,其中有85个完全相同;药对-肺癌的GO功能富集分析得到1648个条目,KEGG通路富集分析得到186条信号通路;药对-抗血管生成的GO功能富集分析得到1844个条目,KEGG通路富集分析得到188条信号通路.分子对接结果显示靶点与成分的亲和作用较好,之间的作用力主要包括氢键作用和疏水作用.体外细胞实验表明两药配伍作为药对使用可增强对HUVECs细胞活力的抑制作用.斑马鱼实验的结果表明,药对和单味药的毒性顺序为CR>CR-SR>SR,抗血管生成活性顺序为CR-SR>SR>CR;qRT-PCR结果显示,药对及单味药能显著降低血管生成相关基因VEGFA、VEGFR2、EGFR、MMP9等的表达水平.结论 药对及单味药抗肺癌和抗血管生成作用于多个相同靶点调节多条相同信号通路,且配伍使用能够增强抗血管生成作用,药对可能通过调控VEGFA、VEGFR2、EGFR等血管生成相关基因以发挥抗血管生成作用从而治疗肺癌.
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