青黛作用于急性幼粒细胞白血病的可视化"药靶蛋白模型"分析

Analysis of Visible"Drug Target Protein Model"of Natural Indigo on Acute Promyelocytic Leukemia

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摘要目的:目前青黛已是治疗急性幼粒细胞白血病(APL)的临床有效药物,但其分子机制与物质基础仍不明确.基于此本研究构建青黛与APL可视化药靶蛋白模型,以探究青黛作用于APL的分子机制.方法:通过GEO数据库检索APL微阵列芯片分析APL差异表达基因,使用TCMSP数据库筛选青黛活性成分,结合PubChem和SwissTargetPrediction匹配活性成分的靶基因并进行富集分析.String用于挖掘并构建APL可视化蛋白互作数据,将其读入Cytoscape,通过Centiscape实现网络拓扑分析.综合APL差异表达基因,通过Sybyl与青黛活性成分构建药靶蛋白模型.结果:筛选出3张APL微阵列芯片,164个差异表达基因,9种青黛活性成分,541个靶基因,这些靶点较多地参与细胞凋亡、药物结合、癌症途径、慢性粒细胞白血病等,这些都在APL中起重要作用.拓扑分析显示ELANE,CTSS为核心基因,将其与青黛9种活性成分进行药靶蛋白模型预测,显示靛玉红和靛蓝与核心基因结合度最佳.结论:APL是受多基因调控的复杂疾病,而青黛成分中靛玉红和靛蓝可通过结合ELANE,CTSS作用于APL的发生发展.

作者王雪 ^[1] 孙长岗 ^[2] 学术成果认领

作者单位青岛大学基础医学院,青岛,266033 ^[1] 山东中医药大学中医药创新研究院,济南,250014 ^[2]

关键词急性幼粒细胞白血病青黛药靶蛋白模型靛玉红靛蓝基因网络药理生物信息 Acute promyelocytic leukemia Natural Indigo Drug target protein model Indirubin Indigo Gene Network pharmacology Biological information

分类号 R285.6

栏目名称 中药研究

DOI 10.3969/j.issn.1673-7202.2020.12.004

发布时间 2020-11-06

基金项目

国家自然自然科学基金项目 —药物分子网络拟合模式指导下青黄散作用于急性早幼粒细胞白血病药靶蛋白机制的"分子动力-3D-QSAR"微观呈现 国家自然自然科学基金项目 —蛋白质相互作用网络与分子对接技术指导下青黄散对慢粒的作用机制研究 国家自然科学基金青年基金项目 —基于"血清药物化学-计算机辅助分子预测-药靶蛋白协同"三维模式下青黄散治疗慢粒的配伍机制研究