基于生信分析探讨金雀异黄素对非小细胞肺癌的影响
Effect of Genistein on Non-small Cell Lung Cancer Based on Bioinformatics Analysis
摘要目的:通过生物信息学分析和细胞生物学实验,探究金雀异黄素对非小细胞肺癌(NSCLC)A549细胞系的影响及潜在治疗靶点.方法:将肺癌细胞A549分为对照组和金雀异黄素给药组(100 μmol/L),处理48 h后,使用核糖核酸(RNA)试剂盒提取细胞的RNA.将提取出的RNA进行转录组测序.所得到的差异基因在sangerbox网站进行热图和火山图分析;运用Matascape网站进行基因本体(GO)富集分析;利用在线网站Omicshare进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;将药物与疾病交集靶点上传至Cytoscape_v3.7.2数据平台进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析.通过流式细胞术验证金雀异黄素对肺癌细胞周期的影响.结果:与对照组比较,金雀异黄素给药后,mRNA的表达发生了改变,2组差异明显.共筛选出4 630个差异基因的表达,其中有2 853个上升基因,1 777个下降基因.KEGG富集分析显示,金雀异黄素给药后影响了细胞周期(Cell cycle).细胞周期实验结果表明,金雀异黄素将肺癌细胞周期阻滞在G2/M期,并同时影响了细胞有丝分裂进程.结论:金雀异黄素可能通过影响A549细胞周期、DNA复制、p53等信号通路抑制NSCLC进程.
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