换一批AlphaFold时代的蛋白质相关人工智能算法及其应用
Protein-Related Artificial Intelligence Algorithms and Their Applications in the AlphaFold Era
摘要蛋白质是生命活动的物质基础.蛋白质的功能取决于其空间结构,因此解析蛋白质的空间结构对于理解其功能至关重要.人工智能(artificial intelligence,AI)模型的利用极大地推进了蛋白质空间结构预测算法的开发,AlphaFold2是该领域里程碑式的成果,使得快速、准确且大规模的蛋白质空间结构预测成为可能.此外,蛋白质语言模型、蛋白质相互作用预测以及蛋白质设计等领域均在AlphaFold时代迎来快速发展,代表性的模型包括ESM2、ScanNet、RFdiffusion和RoseT-TAFold-All Atom等.这些基于人工智能的新算法的开发极大地促进了蛋白质功能、诱发疾病的机制和药物设计等领域的研究.
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关键词
蛋白质结构预测AlphaFold2蛋白质语言模型蛋白质相互作用预测蛋白质设计protein structure predictionAlphaFold2protein language modelprotein interac-tion predictionprotein design
分类号
Q811.4（生物工程学仿生学）
栏目名称
DOI
10.20059/j.cnki.pps.2025.02.1006
发布时间
2025-07-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（32270603）
北京市自然科学基金面上项目（5242010）
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