摘要利用分散量的数学理论,提出了基于最小分散增量的蛋白质序列辨识方法,通过多种特征联合对蛋白质序列进行编码,并建立基于最小分散增量的分类器MID-OMP,应用于革兰氏阴性细菌外膜蛋白序列辩识,在数据集上的Jackknife测试中,MID_OMP辨识外膜蛋白和α螺旋跨膜蛋白的准确率达到95.7%,辨识外膜蛋白和球状蛋白的准确率达到91.0%;在14个细菌基因组内挖掘结果显示,MID_OMP具有较高的敏感性和特异性,预测结果的可信度明显优于另外一种OMPs挖掘工具TMBETA-GENOME.
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