换一批摘要自提出全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)设想以来,在人类复杂疾病和水稻农艺性状关联研究方面,GWAS已得到广泛运用.但作为一种典型的单标记研究方法,GWAS不能检测小效应的遗传变异,而稀有变异间的联合效应往往与表型密切相关,因此,需对GWAS结果进行深入的数据挖掘.基于通路的分析方法(pathway-based analysis,PBA)就是利用基因功能、生物代谢通路等相关信息建立的对GWAS结果进行二次挖掘的方法.该方法能从GWAS结果挖掘出与性状、疾病相关联的通路及具有相同功能的基因集等数据,从而获得更多的遗传信息.现对PBA的出现、计算方法和相关软件进行简要综述,以期为人们进行通路分析提供参考.
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关键词
全基因组关联分析(GWAS)基于通路的分析方法(PBA)单核苷酸多态性生物信息学疾病农艺性状genome-wide association study (GWAS)pathway-based analysis (PBA)single nucleotide polymorphism (SNP)bioinformaticsdiseaseagronomic traits
分类号
Q-31（生物科学研究法）
栏目名称
DOI
10.16605/j.cnki.1007-7847.2016.04.011
发布时间
2016-09-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
人才培养项目（14118480）
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