换一批茶陵野生稻冷响应基因OrCrGHl的表达与克隆
Expression and Cloning of OrCrGHl,a Novel Cold-responsive Gene in Chaling Common Wild Rice
摘要为了发现新的水稻耐逆基因,采用水稻基因芯片分析了茶陵野生稻及籼型栽培稻培矮64S苗期全基因组在冷胁迫下的表达水平,从茶陵野生稻中筛选出一个强烈响应低温的耐冷候选基因,暂命名为OrCrGHl(Oryza rufipogon cold responsive glucan hydrolase-like).用实时定量PCR方法对其表达水平进行了进一步的分析,所得结果与基因芯片分析结果基本吻合.以茶陵野生稻为材料,用逆转录PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR)方法获得了包含其完整开放阅读框(openreading frame,ORF)的cDNA克隆.根据其ORF序列进行预测,该基因编码一个包含558个氨基酸残基的糖基水解酶相似蛋白质,其理论分子质量为59.252 kD,pI为5.81.经蛋白质相似性比对,其编码蛋白与日本晴第7号染色体上的LOC4343492基因编码的蛋白质(XP_015647631.1,glucan endo-1,3-beta-glucosidase GⅡ isoform X2)的氨基酸序列完全一致,与籼稻 93-11 预测蛋白质(EEC82204.1,hypothetical protein OsI_26347)的相似性为99.28％.对其可能的启动子区域序列进行分析,发现了多个可能与逆境或逆境激素响应有关的顺式作用调控元件.以上结果提示,该基因为一新的野生稻耐冷候选基因,进一步的研究正在进行.
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DOI
10.16605/j.cnki.1007-7847.2023.05.0154
发布时间
2023-12-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
湖南省自然科学基金项目（2023JJ30397）
湖南省自然科学基金项目（2021JJ50134）
长沙市自然科学基金资助项目（kq2202243）
长沙市自然科学基金资助项目（kq2014077）
湖南师范大学博士科研启动项目（2020）
湖南省教育厅重点科研项目（19A289）
中国科学院重点实验室开放基金（ISA2015201）
湖南省重点科技计划项目（2012FJ2013）
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