基于COI和16S rRNA基因序列的鱼胶基原鱼种DNA条形码鉴定
DNA Barcoding identification on original species of isinglass through COI and 16S rRNA sequences
摘要目的 建立基于COI和 16S rRNA基因序列的DNA条形码鱼胶基原鱼种鉴定方法.方法 以汕头、厦门、莆田等地采集的 28份鱼胶为研究对象,利用形态归类法对 28份样品进行观察,再提取基因组DNA,分别利用 6 对引物扩增COI和 16S rRNA基因序列并双向测序.聚合酶链式反应(polymerasechain reaction,PCR)产物测序分析后,输入Genbank中进行BLAST分析比对,再利用最大似然法(maximum likelihood,ML)进行系统发育分析.结果 采集的 28 份鱼胶样品可分为 11 种类型,主要有萝卜型、"Y"字型、心型、纸片型和琵琶型等.BLAST分析比对共鉴定出 26 份鱼胶样品基原鱼种,隶属于 5 目 6 科 9 属 12 种.系统发育分析表明不同种类的鱼胶处于不同分支中.结论 该方法可用于鱼胶基原鱼种的快速分子鉴定,也为鱼胶的真伪鉴定及溯源提供理论依据.
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