宏基因组测序分析熟制禽肉制品污染微生物中整合子组成
Analysis of integrative and conjugative elements composition in contaminated microorganisms of cooked poultry products by metagenomic sequencing
摘要目的 研究熟制禽肉制品污染微生物中整合子的分布、来源及其携带的基因盒内容等相关情况.方法 采购熟制鸭肉,对样品进行DNA提取,测序、混合拼接、分箱,获取宏基因组组装基因组,整合子数据库比对.结果 熟制鸭肉污染微生物中检测到65种整合子,共计110个,主要来源于31种宿主微生物,包括中生根瘤菌属、铜绿假单胞菌与肺炎克雷伯氏菌等;整合子中共有9种转座酶,1种毒力因子基因,19个抗性相关基因,其中四环素抗性基因10个,防御基因11个,均为防御噬菌体的基因.结论 多种整合子及毒力因子、抗性相关和防御基因的发现,揭示了食品中微生物遗传多样性的复杂程度,为研究基因的水平转移提供了重要线索,对于评估食品安全性、预防和控制食源性病原体具有重要意义.
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