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重组酶聚合酶扩增探针辅助荧光与胶体金试纸条双模式快速鉴定GⅡ型诺如病毒单碱基突变

Dual-mode rapid identification of GⅡ norovirus single nucleotide polymorphism by recombinase polymerase amplification probe-assisted fluorescence and lateral flow strip

摘要目的 建立基于重组酶聚合酶扩增(recombinase polymerase amplification,RPA)探针辅助荧光与胶体金试纸条双模式快速检测GⅡ型诺如病毒单碱基突变(single nucleotide polymorphism,SNP)的方法.方法 本研究应用扩增阻滞突变系统(amplification refractory mutation system,ARMS)技术与RPA技术结合胶体金试纸条检测GⅡ型诺如病毒的单个碱基突变.选定编码GⅡ型诺如病毒RdRp和VP1蛋白的一段基因区域,主动设计单个碱基的突变,以此作为靶基因,设计并合成高特异性引物,扩增产物上样后通过试纸条控制线(C线)、检测线(T线)显色强度判读结果.优化胶体金与抗体偶联体系后进行了特异性、灵敏度、重复性和稳定性实验,并检测了食品加标样本.同时用荧光法作为辅助手段来验证试纸条结果的可靠性.结果 本方法可在43℃下反应25 min识别单个碱基的突变,检出限为102 copies/μL,可检测低至1%的突变,与荧光法检测结果一致.结论 本研究建立的基于ARMS-RPA结合胶体金试纸条的GⅡ型诺如病毒突变检测方法,不仅能够实现单碱基突变的可视化检测,而且操作简便、检测速度快、灵敏度高,还可在现场即时检测,具有良好的应用前景.

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