换一批汕头市水产品非O1/O139群霍乱弧菌基因组特征分析
Genetic characterization analysis of non-O1/non-O139 Vibrio cholerae strains of aquatic products in Shantou
摘要目的 了解汕头市水产品非O1/O139群霍乱弧菌的耐药基因、毒力基因、序列位点信息,分析不同菌株间遗传关系.方法 收集分离自水产品的霍乱弧菌41株,对菌株进行全基因组序列测定,利用生物信息学工具预测菌株的耐药基因和毒力基因情况,结合美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)数据库,进行多位点序列分型分析(multilocus sequence typing,MLST)和核心基因组单核苷酸多态性分析(core gene single nucleotide polymorphism,cgSNP).结果 41株霍乱弧菌共检测到34个抗生素耐药基因,携带率最高的是dfrA31(46.3％),部分菌株携带能水解所有β-内酰胺酶的blaNDM-1基因.毒力基因携带率最高的是rtxA(100.0％)和hlyA(97.6％),所有病原菌株均不携带ctxA和ctxB,致病岛VPI-1/VPI-2携带率分别为31.7％/70.7％,T6SS和第7次大流行特征基因岛VSP-1/VSP-2的检出率都是4.9％.MLST和cgSNP分析显示,共有30种不同的序列型(sequencetypes,STs),其中20种为新分配的STs.结论 汕头市水产品中非O1/O139群霍乱弧菌携带多种毒力基因和耐药基因,其中霍乱弧菌携带blaNDM-1基因为国内首次报道.不同物种来源的菌株遗传多样性高,发现大量新STs型.
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关键词
水产品非O1/O139霍乱弧菌耐药基因毒力基因blaNDM-1基因多位点序列分型分析核心基因组单核苷酸多态性分析aquatic productsnon-Ol/non-O139 Vibrio choleraeantimicrobial resistance genesvirulence genesblaNDM-1 genemultilocus sequence typingcore gene single nucleotide polymorphism
栏目名称
DOI
10.19812/j.cnki.jfsq11-5956/ts.20250828001
发布时间
2025-12-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
汕头市医疗卫生科技计划项目（230501166493630）
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