换一批拟穴青蟹新型过敏原肌质钙结合蛋白的纯化、鉴定及分子克隆
Purification, Identification and Cloning of a Novel Crab Allergen, Sarcoplasmic Calcium Binding Protein, from Scylla paramamosain
摘要为进一步认识蟹类的过敏原,采用免疫印迹方法,分析发现甲壳类过敏患者血清能与拟穴青蟹肌浆蛋白中分子质量约为21 kD的蛋白质产生特异的IgE结合反应,结果显示该蛋白可能是蟹类新型过敏原.通过硫酸铵盐析、阴离子交换和凝胶过滤柱层析等方法对21kD-蛋白进行分离纯化,采用Western blotting和基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization-time of flight-mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)确认纯化的21 kD-蛋白为肌质钙结合蛋白(sarcoplasmic calcium binding protein,SCP).采用SMART-RACE (Switching Mechanism At RNA Termini-Rapid Amplification of cDNA Ends)的方法获得SCP的cDNA序列,该序列全长986 bp,开放阅读框为579 bp,编码193个氨基酸,其理论分子质量21.94kD,等电点4.44.拟穴青蟹SCP与甲壳类动物SCP具有较高的同源性,与昆虫SCP的同源性较差;三级结构模拟分析显示,SCP含有5个螺旋-转角-螺旋结构区,即EF-手型结构区,并在其中两个手型结构区形成2个钙离子结合位点;进一步预测得到SCP的4个线性抗原表位和3个构象性抗原表位.
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关键词
拟穴青蟹新型过敏原肌质钙结合蛋白纯化质谱分析分子克隆生物信息学分析Scylla paramamosainnovel allergensarcoplasmic calcium binding proteinpurificationmass spectrometrycloningbioinformatics analysis
栏目名称
DOI
10.7506/spkx1002-6630-201403025
发布时间
2014-07-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金项目（31171660）；
福建省杰出青年科学基金项目（2010J06012）
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