换一批基于比较基因组学的Clostridium kluyveri己酸代谢途径关键酶生物信息学分析
Bioinformatics Analysis of the Key Enzymes of the Hexanoic Acid Metabolic Pathway in Clostridium kluyveri Based on Comparative Genomics
摘要对3株白酒来源重要的己酸生产菌株Clostridium kluyveri(NBRC 12016、JZZ和DSM 555)全基因组信息进行比较基因组学分析,聚焦于己酸代谢途径核心催化酶,发现NBRC 12016的己酸代谢途径未得到有效注释,JZZ的己酸代谢途径核心催化酶酰基辅酶A脱氢酶存在注释错误.进一步对C kluyveri模式菌株DSM 555己酸代谢途径的关键酶硫解酶ThlA进行生物信息学分析,发现DSM 555携带3拷贝的Th/A,且具有序列多态性,可能与催化脂肪酸代谢链延长的底物特异性相关.结构分析和分子对接表明,硫解酶ThlA1的底物催化属于氧化还原开关调控机制,并预测了酶的关键催化位点和具体的催化过程.上述分析结果有助于为后续进一步改进菌株的己酸生产性能和更好地应用于白酒酿造提供依据.
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分类号
Q71（生物大分子的结构和功能）
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DOI
10.7506/spkx1002-6630-20180413-183
发布时间
2019-05-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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