换一批嗜热链球菌KLDS3.1012胞外多糖合成途径的基因组学及表型特征分析
Genomic and Phenotypic Characterization of the Biosynthesis Pathway of Exopolysaccharides in Streptococcus thermophilus KLDS3.1012
摘要在分子水平上挖掘嗜热链球菌KLDS3.1012合成胞外多糖的途径并且通过表型特征进行验证.首先,基于Illumina HiSeq与Illumina MiSeq测序平台对菌株KLDS3.1012进行基因组测序并构建基因组图谱;随后,从糖代谢、糖核苷酸合成、胞外多糖基因簇等方面进行生物信息学分析;最后,利用API 50CH测定菌株KLDS3.1012的糖发酵情况及采用高效离子交换色谱法测定胞外多糖的单糖组成.生物信息学分析结果表明菌株KLDS3.1012具有半乳糖、葡萄糖、果糖、甘露糖、乳糖和蔗糖转运系统和4种糖核苷酸(UDP-葡萄糖、dTDP-鼠李糖、UDP-半乳糖和UDP-N-乙酰葡糖胺)合成的相关基因及1个胞外多糖合成基因簇.表型特征分析结果表明菌株KLDS3.1012可以利用以上6种碳源并能形成由鼠李糖、半乳糖和葡萄糖组成的胞外多糖.本研究为分析该菌株合成胞外多糖的遗传基础与胞外多糖结构的关系提供理论依据,并对将其开发为发酵剂具有一定指导意义.
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