换一批
换一批1株牦牛乳源产细菌素融合魏斯氏菌ZW21全基因组测序及序列分析
Whole Genome Sequencing and Sequence Analysis of a Yak Milk-Derived Bacteriocin-Producing Weissella confusa ZW21
摘要融合魏斯氏菌(Weissella confusa)ZW2 1是1 株具有良好抗菌活性的牦牛乳源乳酸菌,为探索其抗菌机理,分析其全基因组序列并挖掘该菌株的抗菌等功能特性基因.本研究基于Illumina NovaSeq PE150平台对W.confusa ZW21进行全基因组测序分析,并采用基因功能、京都基因与基因组百科全书、蛋白质直系同源簇、非冗余蛋白、碳水化合物活性酶数据库、转运蛋白分类数据库进行基因组基本功能注释.结果表明:W.confusa ZW21的基因组大小为2.44 Mb,GC含量45.66％;预测到2 175 个编码基因,编码基因总长度为1 947 771 bp,平均长度为896 bp;通过功能数据库对该菌株基因组基本功能注释和代谢通路基因信息注释可知,基因组中含有8 种细菌素(如大肠菌素V和乳球菌素)相关基因、3 种与抗氧化活性相关基因,以及可调控免疫和炎症信号通路(如核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白受体信号通路、过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路)和编码抗叶酸的基因.综上,W.confusa ZW21全基因组测序及分析为研究其抗菌机理提供基础.
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关键词
牦牛乳融合魏斯氏菌全基因组测序基因功能注释细菌素yak milkWeissella confusawhole genome sequencinggene function annotationbacteriocin
分类号
TS201.3
栏目名称
DOI
10.7506/spkx1002-6630-20221126-303
发布时间
2023-11-28
基金项目
国家自然科学基金（31660468）
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