换一批牛HSPA6蛋白特性分析及蛋白互作网络构建
Characteristics Analysis of Bovine HSPA6 Protein and Construction of Protein Interaction Network
摘要通过构建牛热休克蛋白A6(heat shock protein A6,HSPA6)序列与其他生物的系统进化树,以及运用生物信息学方法分析牛HSPA6蛋白的基本理化性质、亲疏水性等,并结合蛋白互作网络,探究牛HSPA6基因编码蛋白的结构和功能特性.结果显示,牛HSPA6蛋白与羊、长江江豚等哺乳动物的氨基酸序列相似性较高;牛HSPA6蛋白分子质量为70 570.64 u,理论等电点为5.66,为酸性亲水性蛋白,无跨膜结构和信号肽;可能存在11个得分＞0.900的磷酸化位点,与N-糖基化激活位点可能位于后端碱基;牛HSPA6蛋白是一种主要由40.38％的α-螺旋和33.65％的无规卷曲组成的二级结构相对稳定的蛋白质,包含N-端核苷酸结合域和C-端多肽结合域两个主要的结构域,主要在细胞质中发挥作用;蛋白质互作网络构建结果显示,牛HSPA6蛋白主要与BAG1、DNAJA4、DNAJB1、DNAJC2等蛋白发生互作,参与腺苷酸交换因子活性、ATP酶调节活性、伴侣绑定等,表明牛HSPA6蛋白在牛机体能量代谢等过程中发挥潜在生物学功能.这些多重生物信息学分析为深入探讨牛HSPA6蛋白对肉品质的影响机制提供了理论依据.
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关键词
牛热休克蛋白A6结构特点功能特性蛋白质互作网络Bos taurusheat shock protein A6structural featuresfunctional propertiesprotein interaction network
分类号
TS251.52
栏目名称
DOI
10.7506/spkx1002-6630-20230323-228
发布时间
2024-04-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（32160535）
宁夏回族自治区重点研发项目（2017BY068）
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