换一批新疆喀什地区人体肠道共栖菌瘤胃联合乳杆菌菌株的遗传差异及益生特性比较分析
Comparative Analysis of Genetic Differences and Probiotic Characteristics of Human Gut-Dwelling Ligilactobacillus ruminis in Kashi,Xinjiang
摘要本研究以从健康家庭人体粪便样品中分离出的16 株瘤胃联合乳杆菌(Ligilactobacillus ruminis)菌株为研究对象,在分析其基因组、系统发育特征的基础上,对菌株的体外益生特性进行比较分析.基因组分析表明,L.ruminis菌株的平均基因组大小、基因数量和GC含量分别为1.4 Mb、1 374 个、43.55%,尤其菌株间特有基因数量差异显著,在3～886 个之间(菌株K646-58L的特有基因数量明显高于其他菌株);系统进化分析结果显示,同一家族个体来源的菌株在进化树上并没有形成以家族为更相近的聚类;碳源利用实验表明L.ruminis菌株能利用大豆低聚糖、棉子糖无水物和麦芽糊精,不能利用山梨醇和木糖醇,碳水化合物活性酶数据库注释到大量参与聚糖底物代谢的基因,如糖苷水解酶(glycoside hydrolase,GH)1和GH13基因家族;L.ruminis菌株对氨基糖苷类抗生素耐药,对四环素类抗生素和氯霉素敏感,与抗性基因预测存在不匹配的情况;L.ruminis菌株普遍具有高度的自凝聚能力(＞50%)和较好的疏水性(＞20%).L.ruminis菌株基因型特征结合表型特征的研究说明其具有优良的益生特性,尤其是菌株K227-6L和K645-5L,本研究结果可为潜在益生菌菌株的开发与应用奠定理论基础.
更多相关知识
- 浏览3
- 被引0
- 下载1
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
