换一批
换一批摘要长双歧杆菌由于其具有的益生功能而备受关注,该文旨在基于全基因组分析,揭示长双歧杆菌W13(Bifi-dobacterium longum W13)的基因特性,分析其功能基因和代谢通路.结果表明,长双歧杆菌W13隶属于长亚种,通过直系同源蛋白分组比对(evolutionary genealogy of genes:non-supervised orthologous groups,eggNOG)数据库注释,发现氨基酸代谢、碳水化合物代谢是该菌株的主要代谢功能;通过京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)数据库注释,发现菌株中含有较多的群体感应相关基因,表明该菌株可促进肠道稳态.通过碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZy)数据库注释,发现该菌株具有较高的糖合成能力.最后,通过比较基因组分析,发现长双歧杆菌长亚种的遗传多样性和稳定性较高,相较于其他长双歧杆菌长亚种,菌株W13 含有其特定的功能基因.综上表明菌株W13具有一定的益生功能,有开发为益生菌的潜力.
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关键词
益生菌长双歧杆菌基因组比较基因组基因功能注释probioticsBifidobacterium longumgenomecomparative genomegene function annotation
栏目名称
生物工程
DOI
10.12161/j.issn.1005-6521.2023.18.025
发布时间
2023-09-27
基金项目
国家自然科学基金
天津市大学生创新创业训练计划项目
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