换一批摘要为探究导致不同黑曲霉中赭曲霉毒素A(ochratoxin A,OTA)生物合成差异的原因并对毒素进行去除及防控,该研究选用黑曲霉CICC 41702 与黑曲霉 3.316 为试验材料,利用全基因组重测序分析两株黑曲霉菌株基因组水平的差异及OTA生物合成的机制.利用Illumina技术对产和不产OTA的两株黑曲霉菌株进行全基因组重测序,并以黑曲霉CBS 513.88 的基因组序列为参考,深度挖掘单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)、插入或删除(insertions or deletions,InDel)、结构性变异(structural variants,SV)、拷贝数变异(copy number variation,CNV)等信息,并对参与OTA生物合成的基因进行特异性生物信息学分析.结果表明,黑曲霉 3.316 比黑曲霉CICC 41702 显示出更高的变异,且An15g07920 基因在黑曲霉 3.316 中存在大量的非同义突变并显示缺失了 23 600 bp,推测这可能是导致两株黑曲霉的OTA生物合成差异的原因.
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关键词
黑曲霉赭曲霉毒素A单核苷酸多态性(SNP)插入或删除(InDel)结构性变异(SV)拷贝数变异(CNV)基因组多样性Aspergillus nigerochratoxin Asingle nucleotide polymorphism(SNP)insertions and dele-tions(InDel)structural variants(SV)copy number variation(CNV)genomic diversity
栏目名称
DOI
10.12161/j.issn.1005-6521.2024.19.024
发布时间
2024-10-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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