摘要红曲霉(Monascus spp.)是一种可产生红曲色素(monascus pigments,MPs)、莫纳可林K(moncolin K,MK)、γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA)等多种有益代谢产物的工业用重要生产菌种.该文对 4 株高产红色素的红曲霉(M7、NRRL 1597、NRRL 1596、YY-1)全局调控因子VeA、VelB进行基因组学分析.结果表明:4 株红曲霉VeA基因编码的蛋白均含有 1 个天鹅绒(velvet)结构域、核定位信号(nuclear localization signal,NLS)和不稳定的富脯氨酸区域(proline-,glutamic acid-,serine-,and threonine-rich sequence,PEST);VelB基因编码的蛋白含有 2 个velvet结构域,不含NLS区域.VeA蛋白与典型丝状真菌的VeA蛋白相似度为 37.4%～62.5%;红曲霉VelB蛋白与典型丝状真菌相似度为 51.2%～84.1%,这说明红曲霉VeA蛋白和VelB蛋白具有类似于其它丝状真菌的功能.红曲霉VeA蛋白、VelB蛋白的一级结构主要由脯氨酸和丝氨酸组成,不含明显跨膜结构域和信号肽;红曲霉VeA蛋白主要位于细胞核内,VelB蛋白在细胞核和细胞质均有分布;VeA蛋白和VelB蛋白均具有多个丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸激酶磷酸化位点;VeA蛋白二级结构主要为β-折叠和无规则卷曲结构,VelB蛋白主要为α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲结构;红曲霉VeA蛋白、VelB蛋白三级结构模型与典型丝状真菌VeA蛋白、VelB蛋白三级结构模型相似,蛋白相互作用网络预测VeA蛋白和VelB蛋白间可以相互作用.上述分析结果推测红曲霉VeA蛋白、VelB蛋白的功能及作用机理可能与其它真菌相似,具有调控菌株的生长发育、次级代谢等功能.