换一批一株产核黄素类布氏乳杆菌C41的全基因组测序及分析
Sequencing and Analysis of Whole Genome of Lentilactobacillus parabuchneri C41 Producing Riboflavin
摘要类布氏乳杆菌(Lentilactobacillus parabuchneri)C41 是一株从番茄发酵液分离的产核黄素菌株,该文通过全基因组测序分析探究C41 菌株的产核黄素机制和潜在危害.采用Pacbio加Illumina测序的方法获取C41 菌株全基因组序列,通过编码基因预测和基因注释等生物信息学方法分析菌株的有关功能机制和潜在危害性.结果显示,C41菌株基因组含 1 个环状DNA和 3 个质粒,环状DNA大小为 2650018 bp,GC含量为 43.53%,质粒A、质粒B和质粒C的大小分别为 58659、50453 bp和 49016 bp,预测得到 2802 个编码基因,64 个tRNA基因,15 个rRNA基因.通过KEGG注释发现C41 菌株染色体包含核黄素从头合成所需酶的编码基因.碳水化合物活性酶与次级代谢产物合成基因分析共注释到 66 个碳水化合物活性酶编码基因、1 个Ⅲ型聚酮合酶基因簇和 2 个核糖体合成和翻译后修饰肽基因簇.致病菌毒力因子数据库与综合抗生素耐药性数据库比对分析显示C41 基因组没有基因被注释为毒力基因,1 个基因被注释为抗菌药物耐药相关基因.结果表明C41 菌株具有从头合成核黄素的能力和较好的安全性,具备进一步开发应用的潜力.
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关键词
类布氏乳杆菌核黄素全基因组测序基因功能注释次级代谢产物Lentilactobacillus parabuchneririboflavinwhole genome sequencinggene function annotationsecondary metabolites
栏目名称
DOI
10.12161/j.issn.1005-6521.2026.02.023
发布时间
2026-01-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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