四个奥利亚罗非鱼群体的微卫星分析

THE GENETIC STRUCTURE OF FOUR POPULATIONS OF OREOCHROMIS AUREUS BY MICROSATELLITE DNA ANALYSIS

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摘要应用筛选到的19对微卫星引物,对四个不同来源的奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)群体(奥利亚罗非鱼83系、奥利哑罗非鱼02系、奥利亚罗非鱼05系和红色奥利亚罗非鱼)的基因组DNA进行PCR扩增,分析其群体遗传结构和亲缘关系.根据几个群体在19个位点上的PCR扩增图谱,统计计算各群体的遗传多样性指数.四个群体的平均观测遗传杂合度值在0.154-0.391间;平均预期杂合度在0.181-0.428间;平均多态信息含量值在0.1513-0.3882间,说明它们的遗传多样性水平较低.遗传偏离指数D的评估结果显示这4个群体有多个位点存在不同程度的Hardy-Weinberg遗传平衡偏离.运用MicroChecker软件进行零等位基因预测,结果显示除红色奥利亚罗非鱼群体外,其他3个群体中均可能存在零等位基因位点.各群体零等位基因的位点数分别为:83系1个,02系3个,05系7个,红奥群体为0.零等位基因位点的存在可能是导致位点发生Hardy-Weinberg遗传平衡偏离的原因之一.4个群体中,05系群体与83系群体间的遗传相似性系数最高(0.9422),遗传距离最小(0.0596),说明两者亲缘关系最近;83系群体与红奥群体的遗传相似性系数最低(0.6977),遗传距离最大(0.3599),可推断两者亲缘关系最远.根据群体间的遗传距离采用UPGMA法进行聚类,结果表明:83系首先与05系聚类为一支,然后与02系群体聚类,最后与红奥群体聚类.聚类结果说明红奥群体与其他三个群体亲缘关系最远;83系群体与05系群体亲缘关系最近,与02系群体次之.