换一批鳙Sox基因克隆及序列进化分析
CLONING AND SEQUENCE EVOLUTION ANALYSIS OF SOX GENES IN BIGHEAD CARP (ARISTICHTHYS NOBILIS)
摘要利用简并引物SoxN和Sox9在鳙基因组DNA中进行PCR扩增和产物克隆测序，并对序列进行同源性比较和系统进化分析。结果表明本文鉴定出鳙15个Sox基因HMG盒序列，分别属于 SoxB、SoxC和 SoxE组，依据斑马鱼同源基因将其分别命名为Sox1a、Sox1b、Sox2、Sox3、Sox4a、Sox4b、Sox9a、Sox9b、Sox10、Sox11b、Sox12、Sox14a、Sox14b、Sox19和Sox21a。基于鳙和斑马鱼 Sox1、Sox4和Sox9基因核苷酸序列构建的系统进化树显示这3个Sox基因的复制时间发生在鳙和斑马鱼的分化之前，结果支持了鱼类特异的基因组复制假说。以Sox1a、Sox1b和Sox4基因为分子钟标记构建系统进化树探讨鳙和斑马鱼的分化时间，结果显示，同属于鲤科鱼类的鳙(鲤亚科)和斑马鱼(鱼丹亚科)在原始的鱼丹亚科鱼类中存在一个共同祖先，大约出现在63.7百万年前。研究结果为进一步研究鱼类Sox基因复制和基因组进化等问题提供了重要参考资料。
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关键词
鳙Sox基因基因组加倍系统进化树分化时间Aristichthys nobilisSox geneGenome duplicationPhylogenetic treeDivergenc time
分类号
Q781
DOI
10.7541/2014.94
发布时间
2014-08-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
公益性(农业)行业科研项目（200903045）；
国家自然科学基金项目（31272647）
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