换一批基于18S rDNA遗传距离与GC含量对游走类纤毛虫的分子系统学研究
MOLECULAR PHYLOGENETIC EVIDENCES ON MOBILIDA BASED ON GENETIC DISTANCE AND GC CONTENT OF 18S rDNA USING BROAD TAXON SAMPLING
摘要为了揭示游走类纤毛虫的系统发生,对寄生于淡水鱼类的车轮虫科中的6种车轮虫进行了18S rDNA的测序并获得了9个序列.采用了最大似然法(ML)与贝叶斯法(BI)对GenBank中所有游走类纤毛虫的18S rDNA序列进行了系统树的构建,并首次将SPSS与18S rDNA遗传距离结合分析了游走类纤毛虫的系统发生.研究结果进一步证实了车轮虫属(Trichodina)的非单系发生与小车轮虫属(Trichodinella)的有效性.此外,研究结合18S rDNA的GC含量与遗传距离分析提出了游走类纤毛虫科属及种间新的鉴定依据:18S rDNA的GC含量可用于游走类纤毛虫的科属区分,且与游走类纤毛虫的分化密切相关;18S rDNA的遗传距离在游走类纤毛虫的不同阶元中具有一定的阈值范围,即通常种内遗传距离阈值范围为0.000-0.005,属种间阈值范围为0.005-0.150,当遗传距离大于0.150时,则达到了科间水平.
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关键词
系统发生18S rDNA车轮虫属小车轮虫属GC含量遗传距离Phylogeny18S rDNATrichodinaTrichodinellaGC contentGenetic distances
DOI
10.7541/2016.48
发布时间
2016-11-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
The National Natural Science Foundation of China（(31101637,31172068,31471980)）
the project of Chongqing Science & Technology Commission（(CSTC,2010CA1010,cstc2014jcyjA80008)）
the Science Research Foundation of the Education Committee of Chongqing（(KJ1400530)）
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