换一批斑点叉尾(鲴)GHRH基因3个SNPs位点及其单倍型组合与生长性状的关联分析
THREE SNPS POLYMORPHISM OF GROWTH HORMONE-RELEASING HORMONE GENE (GHRH) AND ASSOCIATION ANALYSIS WITH GROWTH TRAITS IN CHANNEL CATFISH
摘要研究旨在探讨生长激素释放激素基因(Growth hormone-releasing hormone,GHRH)对斑点叉尾(鲴)(Ictalurus punctatus)生长性状的影响.采用DNA混池测序法筛选GHRH基因的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,使用SNaPshot法将筛选到的SNPs多态性位点进行分型,并对这些位点进行连锁不平衡和单倍型分析.结果表明,在GHR基因内含子区域共检测到4个SNPs位点,并成功地对3个位点进行了分型,3个位点间均不存在强连锁不平衡;3个SNPs位点在176尾斑点叉尾(鲴)中形成了6种有效单倍型.关联分析表明SNP位点g.6301 G＞A的AA基因型的体质量显著性地高于AG和GG型(P＜0.05),比群体的平均体质量高14％.单倍型组合H1/H4和H1/H5个体的体质量和体长极显著性地高于其他单倍型组合(P＜0.01),体质量比群体平均体质量分别高30％和15％,体长比群体平均体长分别高7％和6％.研究为斑点叉尾(鲴)生长性状分子标记辅助选育和QTL定位提供了参考依据.
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关键词
斑点叉尾(鲴)GHRHSNPSNaPshot生长性状单倍型分析关联分析Ictalures punctatusGHRHSNPSNaPshotGrowth traitsHaplotypeAssociation
分类号
Q953（动物学遗传学）
DOI
10.7541/2016.114
发布时间
2016-11-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家科技支撑计划（(2012BAD26B03-04)）
江苏省科技支撑计划（(BE2013445)）
江苏省农业科技自主创新基金（(CX(15) 1013)）
江苏省水产三新工程项目（(Y2014-25)）
江苏省六大人才高峰项目（(2014-NY-008)）
Supported by the National Key Technology R &D Program of China（(2012BAD26B03-04)）
Science and Technology Support Program of Jiangsu Province（(BE2013445)）
Independent Innovation on Agriculture Science and Technology of Jiangsu Province（(CX(15)1013)）
the Project of Human Resources and Social Security of Jiangsu Province（(2014-NY-008)）
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