卵巢成熟期和退化期星斑川鲽脑垂体和下丘脑组织的转录组比较分析

COMPARISON ANALYSIS ON TRANSCRIPTOME IN THE PITUITARY GLAND AND HYPOTHALAMUS OF STARRY FLOUNDER (PLATICHTHYS STELLATUS) AT THE OVARY MATURATION AND DEGRADATION STAGES

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摘要为了解星斑川鲽(Starry Flounder,Platichthys stellatus)脑组织基因表达与卵巢发育调控的关系,发掘相关功能基因,研究提取卵巢成熟期和退化期星斑川鲽雌鱼脑垂体和下丘脑组织总RNA,运用HiSeq 2000高通量测序技术进行转录组测序分析.测序结果经拼接组装后共获得30640条Unigenes,Blast同源性比对显示,其中24128条Unigenes获得注释;经eggNog功能注释后29137条Unigenes序列分为26类,分别涉及信号转导、翻译机制等生理生化过程.KEGG pathway数据比对显示,卵巢成熟期涉及98种代谢途径,135条序列表达上调;卵巢退化期涉及192种代谢途径,648条序列表达上调.Unigenes表达量及表达差异分析表明在卵巢成熟期334条序列表达上调,卵巢退化期987条序列表达上调.获得功能注释的Unigene中,408条涉及生殖调控和内分泌调控,参与生殖调控的信号分子有1508条.试验采用实时定量PCR研究了涉及生殖调控和内分泌调控基因促性腺激素释放激素(GnRH)、神经激肽B(NKB)、促性腺激素(GtH)、促滤泡激素(FSH)、肿瘤转移抑制因子(Kiss)以及催乳素释放肽受体(PrRPR)在卵巢两个不同发育时期脑垂体和下丘脑的表达情况,结果表明除FSH外,其余均在卵巢退化期时期脑组织中表达升高,与转录组测序结果趋势一致.

作者周江 ^[1] 王丽娟 ^[2] 王波 ^[3] 郑凤荣 ^[3] 王长海 ^[1] 学术成果认领

作者单位南京农业大学资源与环境学院, 江苏省海洋生物学重点实验室, 南京 210095 ^[1] 中华人民共和国盐城出入境检验检疫局,盐城,224002 ^[2] 国家海洋局第一海洋研究所,青岛,260061 ^[3]

关键词星斑川鲽脑组织转录组测序实时定量PCR Platichthys stellatus Brain tissue Transcriptome sequencing qRT-PCR

主题词脑(Brain)卵巢(Ovary)组织(Tissues)鲽(Flounder)转录组(Transcriptome)

分类号 S961.6

DOI 10.7541/2017.42

发布时间 2017-03-23

基金项目

国家高技术发展计划"863项目" 国家海洋公益性行业科研专项(201305005)资助[Supported by the National High-tech R&D Program "863 Program" Public Science and Technology Research Funds Projects of Ocean (201305005)]