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基于全基因组的龟鳖目Hox基因序列特征及进化分析

EVOLUTIONARY ANALYSES AND SEQUENCE FEATURE OF HOX GENES IN TURTLES

摘要为对Hox基因在龟鳖目物种中进行系统地序列比较分析和进化研究,文章对目前具有染色体水平的龟鳖目基因组进行了Hox基因的鉴定,序列特征、进化和转录组分析.研究结果表明龟鳖物种的Hox基因簇是高度保守的.非重复序列的缺失导致鳖科HoxB9-HoxB13基因间区相对龟科短了 10 kb.大量Hox基因编码区发生了鳖科或龟科特异的序列替换、插入和缺失.胸部骨骼发育相关的Hox基因在鳖科祖先发生了快速进化和受到正选择.Hox基因的表达具有组织、时期特异性,主要在胚胎时期的顶端外胚层嵴、背甲嵴和性腺表达.研究为龟鳖目Hox基因不同胚胎时期的多组学及表达调控分析提供了靶标,也为进一步厘清龟鳖物种演化创新提供了参考.

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水生生物学报

水生生物学报

2023年47卷10期

1617-1627页

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