换一批
换一批一株雷氏普罗维登斯菌的分离鉴定、生物学特性及其基因组学研究
ISOLATION,IDENTIFICATION,BIOLOGICAL CHARACTERISTICS,AND WHOLE-GENOME SEQUENCING OF A PROVIDENCIA RETTGERI STRAIN
摘要为确定2020年6月浙江杭州一发病黄缘闭壳龟的病原体及病原特征,研究从患病龟肝脏中分离到一株优势菌HZ202006,对该菌进行形态学观察、16S rRNA序列分析、全基因组测序、人工感染实验及药敏试验.结果确认该菌株为雷氏普罗维登斯菌(Providencia rettgeri),短杆状,革兰氏阴性菌.全基因组测序显示该菌株完整基因组序列是由一条4.8 Mb的双链DNA和2个质粒组成.利用耐药基因数据库(CARD)和毒力因子数据库(VFDB)对测序基因进行注释,发现该菌有20个耐药基因和4个毒力因子.药敏试验结果显示,HZ202006只对阿米卡星表现为中度敏感,对青霉素类、头孢类、氨基糖苷类等16种常见的抗生素耐药.研究分离并鉴定了一株使黄缘闭壳龟患病的雷氏普罗维登斯菌,为水产养殖动物防控该菌引起的相关疾病提供参考.
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关键词
雷氏普罗维登斯菌分离鉴定药敏实验全基因测序黄缘闭壳龟Providencia rettgeriIsolationIdentificationAntimicrobial susceptibility testWhole genome sequenc-ingCuora flavomarginata
分类号
S947
栏目名称
DOI
10.7541/2024.2024.0085
发布时间
2024-12-13
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