六个繁育场异育银鲫的克隆系鉴定及特征分析

CLONE IDENTIFICATION AND CHARACTERIZTION ANALYSIS OF ALLOGYNOGENETIC GIBEL CARP IN SIX HATCHERIES

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摘要为了厘清湖北省异育银鲫(Carassius gibelio)繁殖群体的种质资源现状,研究以湖北省6个苗种繁殖场的异育银鲫亲本为研究对象,比较不同群体的生物学特征和品质性状的差异,利用基因组重测序进行品种与克隆系鉴定和遗传多样性分析.研究结果表明,根据180尾异育银鲫全基因组重测序的SNPs,共鉴定出10个异育银鲫克隆系,其中2个异育银鲫"中科3号"亚克隆系,5个异育银鲫"中科5号"亚克隆系和3个其他克隆系.遗传多样性分析表明,单核苷酸密度(SNP/kb)、单核苷酸多态性(p)、多态信息含量(PIC)和观测杂合度(Ho)分别为11.17、0.0050、0.4332和0.5612.系统发育树和主成分分析结果显示,不同群体之间表现出中度到高度的遗传分化,同时也存在较为显著的交叉聚类现象,结合异育银鲫克隆系分布,表明除了梁子湖和正大群体外的繁殖亲本存在一定的种质混杂现象.不同克隆系之间的形态上存在差异,体高/体长和头长/体长可以作为初步判断异育银鲫形态的两个参考指标.异育银鲫"中科5号"和异育银鲫"中科3号"的肌肉营养成分中粗脂肪含量差异显著,而粗蛋白含量无明显差异.不同克隆系间的肌肉中17种脂肪酸含量均存在显著差异,DHA+EPA总量在不同克隆系之间也存在差异.研究不仅有利于异育银鲫种质资源的合理开发与保护,而且有助于异育银鲫新品种选育和养殖产业的可持续发展.