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基于叶绿体基因组的中国水麦冬科系统发育研究

PHYLOGENY OF JUNCAGINACEAE IN CHINA BASED ON COMPLETE CHLOROPLAST GENOME

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摘要为探究水麦冬科(Juncaginaceae)系统发育上存在的争议,并丰富水麦冬科物种的遗传信息资源,研究对海韭菜(Triglochin maritima)和水麦冬(Triglochin palustris)叶绿体基因组进行测序、组装、注释和特征分析,并重建其与相关类群的系统发育关系.海韭菜和水麦冬叶绿体基因组呈环状四分体结构,全长分别为155881和155803 bp,分别鉴定出了57和60个SSRs及49个长重复序列.海韭菜和水麦冬叶绿体基因组偏好使用以A/U结尾的密码子.系统发育分析表明水麦冬科两个物种聚为一支,与其近缘类群遗传距离较远,于78.67 MYA与眼子菜属(Potamogeton)、虾海藻属(Phyllospadix)、大叶藻属(Zosterai)、二药藻属(Halodule)、针叶藻属(Syringodium)、川蔓藻属(Ruppia)构成的分支产生分化.结合物种生境与形态特征支持将水麦冬属上升为水麦冬科.研究将不仅为探究水麦冬科叶绿体基因组结构进化奠定理论基础,也能为水麦冬科及相关类群物种保护和科学利用提供理论依据.

作者王璐瑶 ^[1] 周全 ^[2] 樊国有 ^[3] 袁庆 ^[1] 张晶晶 ^[4] 刘海瑞 ^[1] 学术成果认领

作者单位青海大学生态环境工程学院,西宁 810016 ^[1] 青海大学生态环境工程学院,西宁 810016;中国科学院水生生物研究所,武汉 430072;中国科学院大学,北京 100049 ^[2] 青海省黄南藏族自治州麦秀林场,黄南 811399 ^[3] 石家庄医学高等专科学校,石家庄 050599 ^[4]

关键词水麦冬科叶绿体基因组特征系统发育分歧时间 Juncaginaceae Chloroplast genomes characteristics Phylogeny Divergence time

分类号 S567.23+9

栏目名称

生物多样性与资源

DOI 10.7541/2025.2024.0349

发布时间 2025-04-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）