青海湖裸鲤ACSL基因家族的全基因组分析及其盐碱胁迫响应
GENOMIC ANALYSIS OF THE ACSL GENE FAMILY IN THE GYMNOCYPRIS PRZEWALSKII AND ITS RESPONSE TO SALINE-ALKALI STRESS
摘要为探究长链酰基辅酶A合成酶(ACSL)基因家族在青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)盐碱适应中的作用,研究基于裸鲤全基因组数据对ACSL家族进行了系统鉴定,并分析了盐碱胁迫(盐度16.67‰,碱度32 mmol/L)条件下ACSL家族的组织特异表达模式.结果显示,青海湖裸鲤ACSL基因家族包含 9个成员(ACSL1a、ACSL1b、ACSL2、ACSL3a、ACSL3b、ACSL4a、ACSL4b、ACSL5、ACSL6),分别编码640-834个氨基酸.Motif和结构域分析表明,除ACSL3a(缺失motif6、motif10)和ACSL3b(缺失motif10)外,其余成员均拥有10个motif.9个ACSL基因分布于9条染色体(Chr8、13、15、40、41、48、64、82、87).所有ACSL蛋白均为亲水性蛋白,其中ACSL4b产物为酸性蛋白质,其余均为碱性蛋白质.除ACSL2和ACSL3a外,其余均为稳定蛋白.亚细胞定位预测结果显示,ACSL2定位于细胞质,ACSL3a、ACSL3b、ACSL4a、ACSL4b定位于过氧化物酶体,其余均定位于细胞膜.qRT-PCR结果显示,ACSL基因家族成员表现出不同的组织分布模式,ACSL3b、ACSL4b和ACSL5在肾脏中高表达,ACSL3a、ACSL4a和ACSL5在肠道中高表达.在盐碱胁迫后,ACSL2、ACSL3a、ACSL6在鳃组织中显著上调,ACSL1a、ACSL2、ACSL3a、ACSL5在肾脏组织中显著上调,ACSL3b、ACSL6在肠道组织中表达显著上调.研究揭示了青海湖裸鲤ACSL基因家族在盐碱胁迫下通过脂代谢供能、维持渗透平衡及免疫调控的多种生理功能.
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