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高顶鳞皮蚌F和M型线粒体基因组全序列结构比较及双单亲遗传下的进化分析

COMPARATIVE ANALYSIS OF THE F AND M-TYPE MITOCHONDRIAL GENOME ARCHITECTURE AND EVOLUTION IN LEPIDODESMA LANGUILATI(BIVALVIA:UNIONIDAE)UNDER DOUBLY UNIPARENTAL INHERITANCE

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摘要为探讨蚌类在DUI机制下的进化特征,本文通过测序和比较高顶鳞皮蚌F与M型线粒体基因组,并结合系统发育分析和选择压力分析开展研究.结果表明,高顶鳞皮蚌F/M型线粒体全基因组序列全长分别为15768和17008 bp,A+T含量在两型中均约64%,呈AT偏好性;共编码37个基因,包括13个蛋白质编码基因(PCGs),22个tRNA和2个rRNA,其中26个基因位于轻链、11个基因位于重链;tRNA结构存在缺陷,F/M型trnS缺失tψc环,M型trnY缺失DHU环;相对密码子使用频率(RSCU)分析显示TTT在F型(RSCU=1.55)和M型(RSCU=1.63)中均为使用频率最高的密码子;系统发育树显示F/M型线粒体明确分化为两大单系群;基因选择压力分析提示M型Ka/Ks值高于F型,atp8为潜在的性别分化相关基因.本研究系统揭示了高顶鳞皮蚌F和M型线粒体基因组的结构差异、碱基组成、密码子特征及非编码区布局,支持了蚌类F与M型基因组在系统发育上的并行进化模式,不仅为该物种线粒体基因组的深入比较和应用研究提供基础数据,更有助于深化对DUI现象的理解.