摘要为探究水产养殖中养殖不同物种对水体和沉积物中细菌群落的影响,以养殖克氏原螯虾(Procambarus clarkii,PC)和中华鳖(Pelodiscus sinensis,PS)的水体和沉积物样品为研究对象,利用基于16S rRNA基因的高通量测序技术,对细菌群落多样性和群落组成进行分析,并结合环境因子,探究水产养殖对细菌群落的影响.结果显示,水体和沉积物中细菌群落的α多样性均呈现PS＞PC的显著差异(P＜0.05).非度量多维尺度分析的结果显示,PC和PS区的水体和沉积物细菌群落结构均呈现明显差异.冗余分析(RDA)的结果表明,水体氨氮(NH4+-N)和硝酸盐氮(NO3--N)是影响水体细菌群落结构的最主要环境因子,沉积物总氮(TN)、总磷(TP)和有机碳(OC)均对沉积物细菌群落结构有显著影响(P＜0.05).PC和PS区中的细菌隶属于34门、114纲、258目、504科和955属,水体中共筛选出了11个优势菌门(相对丰度＞0.5％),沉积物中筛选出了13个.2个养殖区域的水体样品中共筛选出了15个优势(相对丰度＞1％)操作分类单元(Operational Taxonomic Unit,OUT),其中有9个具有脱氮除磷或去除有机质的作用,它们分别属于丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)、腐螺旋菌科(Saprospiraceae)、嗜甲基菌属(Methylophilus)、放线菌目(Actinomycetales)和沉积杆菌属(Sediminibacterium).整体上,这9个优势OTUs在PC区中的相对丰度更高,并且与氨氮(NH4+-N)和硝酸盐氮(NO3--N)的相关性较强.同时,在沉积物样品中筛选出了7个优势OTUs,其中有3个主要参与氮循环,它们分别属于Dechloromonas属、Prolixibacteraceae科和厌氧绳菌科(Anoerolineaceae).此外,在水体样品中发现了3个优势OTUs为致病菌,分别属于黄杆菌属(Flavobacterium)和多核杆菌属(P5olynucleobacter).综合以上分析,养殖不同物种会对水体和沉积物中细菌群落多样性和结构产生不同影响.